Charlotte Perrey Beaude commence ses études musicales par l’apprentissage du piano, développant rapidement un goût prononcé pour l’improvisation et la composition. Après des études en classe de mathématiques supérieures, elle se consacre pleinement à la musique et se spécialise dans l'écriture auprès de Stéphane Delplace. Elle poursuit ses études au Conservatoire National Supérieur de Paris, où elle obtient les Premiers Prix en Harmonie, Contrepoint, Écriture XXe-XXIe, Fugue et Formes, ainsi que le Prix Marcel-Dautremer. Elle se forme notamment auprès de Jean-François Zygel, Thierry Escaich et Marc-André Dalbavie. Elle enseigne aujourd’hui à l'HEMU – Haute École de Musique et la HEM-Genève.